申请第三方支付牌照的流程如下：

准备申请材料

申请人需要准备一系列的资料和文件，包括但不限于公司营业执照（副本）复印件、公司章程、验资证明、经会计师事务所审计的财务会计报告、支付业务可行性研究报告、反洗钱措施验收材料、技术安全检测认证证明、高级管理人员的履历材料、申请人及其高级管理人员的无犯罪记录证明材料、主要出资人的相关材料等。

提交申请

将准备好的申请材料递交给当地中国人民银行中心支行（简称“中支管”）。。

审核与公示

当地人民银行支行支付结算处、科技处、反洗钱处3个部门审核通过后，将开具受理通知书，并在中国人民银行官网进行公示。。

总行审核与整改

公示后，材料由中支提交到总行，总行审核通过后，会要求支付机构进行整改，并在整改无误后发放支付牌照。。

系统检测认证

申请人所申请的业务类型需要通过系统检测认证，确保符合相关法规要求。。

实地检查

在材料提交无意见后，当地人民银行3部门会联合到申请机构进行实地检查，提出实地中存在的问题整改意见。。

持续合规与监管

获得支付牌照后，支付机构需要持续遵守相关法律法规，接受监管机构的监督和检查，确保业务合规运营。。

建议申请人在申请过程中，详细阅读并遵守《非金融机构支付服务管理办法实施细则》等相关法规，确保所有申请材料的真实性和完整性，以提高申请成功率。